Utiliser une température variable est un réel avantage en digestion anaérobie. Les bactéries facilitant la production de gaz ont une activité plus importante lorsque l'on augmente la température.

En effet, les bactéries thermophiles (qui fonctionnent de 48°C à 52°C) produisent pour une même quantité de biomasse un volume de gaz plus important et ce, quelque soit le temps de séjour hydraulique.

Toutefois, nos unités ne fonctionnent pas toutes en régime thermophile. En effet, le choix de la température repose sur de nombreux paramètres parmi lesquels : le type de biomasse, la concentration en azote, le pH...

La recherche montre que la digestion anaérobie que la température optimale pour les bactéries mésophiles est de 37°C et 52°C pour les bactéries thermophiles. Toutefois, les relations empiriques démontrent qu'il existe des espèces bactériennes se développant et produisant du biogaz entre 37°C et 52°C. Xergi exploite de nombreuses unités de méthanisation avec une gamme de température très large allant de 37°C à 52°C.